Μόνο τα δύο μεγάλα νησιά κατοικούνται, οι Φούρνοι και η Θύμαινα, με έναν μόνιμο πληθυσμό περίπου 1200 ψυχών. Η συντριπτική πλειοψηφία του πληθυσμού κατοικεί στην μικρή κωμόπολη και λιμάνι της Χώρας των Φούρνων, ή απλώς Φούρνους. Οι υπόλοιποι οικισμοί είναι εξαιρετικά μικροί, με μόνες εξαιρέσεις την Χρυσομηλιά στα βόρεια του νησιού των Φούρνων και την Χώρα της Θύμαινας, που αποτελούν μικρά αλλά ζωντανά χωριά.